风淋室压差控制是制药厂洁净厂房净化空调系统设计的重要环节，是保障洁净区洁净度的重要措施。《洁净厂房设计规范》的风淋室压差控制章节包括5条内容，全部是针对风淋室压差控制的条款。风淋室的压差控制基本分为以下几个步骤：
一、确定洁净区各风淋室的压差按照《洁净规范》6.2.1条和6.2.2条的要求，风淋室与周围的空间应该维持一定的压差，并应按生产工艺要求决定维持正压差或负压差。不同等级的风淋室以及洁净区与非洁净区之间的压差，应不小于5帕，洁净区与室外的压差应不小于10帕。
二、确定维持压差的压差风量洁净区各风淋室维持正压差的压差风量，需要由室外新风补充。因此风淋室正压差风量的大小，直接影响到净化空调系统的新风比，以及净化空调系统的耗能量。洁净区各风淋室维持负压差的压差风量，由该风淋室外渗入在很多情况下，其是未经净化处理的室外风，因此风淋室负压差风量的大小，直接关系到负压风淋室的洁净度。
三、维持风淋室压差恒定一般情况下，采取定风量系统的方式较多，即保障风淋室送风量相对恒定，调节风淋室回风量或排风量，从而控制风淋室压差风量，维持风淋室压差值；还可在风淋室回（排）风支管上安装手动对开多叶调节阀或蝶阀，调节回（排）风量，控制室内压差，其优点是设备简单，有效。
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